בסוף שנות ה-60, עם התפתחות התחבורה האווירית, החליטה הנהלת צים לסגור את קווי הנוסעים ולהתרכז בפיתוח קווי משא. צים הגיעה לכל היבשות והחלה להפעיל אוניות מתמחות: אוניות צובר, אוניות קירור ומכליות דלק. תחום פעילות חשוב של החברה היה הובלת נפט איראני לישראל ומוצרי נפט מעובדים מישראל לאירופה.

אוניית המכולות החדישה 'צים חיפה'

צים מילאה תפקיד מרכזי במהפכה הטכנולוגית העיקרית של המאה ה-20 בעולם הספנות, המעבר להובלה במכולות. החברה זיהתה את המגמה החדשה כבר בתחילתה והזמינה שש אוניות משוכללות מהדור הראשון של אוניות המכולה. בהמשך הייתה צים מהחברות הראשונות בפיתוח עידן ההובלה "מדלת לדלת" - שילוב של הובלה ימית והובלה יבשתית מן הנמל ואליו ולא רק מנמל לנמל בלבד.